מאז צ'ארלס דארווין הראשון עלה עם תורת האבולוציה והרעיון שלו ברירה טבעית, אבולוציה היה א נושא שנוי במחלוקת בשביל הרבה אנשים. בעוד תומכי התיאוריה מצביעים על ההר הבלתי נגמר לכאורה של עדויות להתפתחותהמבקרים עדיין מכחישים כי האבולוציה היא למעשה עובדה. אחת הטענות הנפוצות ביותר נגד האבולוציה היא שיש פערים רבים או "קישורים חסרים" בתוך ה- מאזן מאובנים.
קישורים חסרים אלה יהיו מה שמדענים רואים כמאובני מעבר. מאובני מעבר הם שרידים של אורגניזם שהגיע בין גרסה ידועה של מין למין הנוכחי. לכאורה, מאובני מעבר היו עדות להתפתחות מכיוון שהוא יראה צורות ביניים של מין והם שינו וצברו התאמות בקצב איטי.
לרוע המזל, מכיוון שהתיעוד המאובנים אינו שלם, ישנם חסרים רבים של מאובני מעבר שיכולים להשתיק את מבקרי האבולוציה. ללא עדות זו, מתנגדי התאוריה טוענים כי אסור היה להתקיים צורות מעבר אלה ומשמעות הדבר היא שהאבולוציה אינה נכונה. עם זאת, ישנן דרכים אחרות להסביר את היעדרן של כמה מאובני המעבר.
הסבר אחד נמצא באופן בו מייצרים מאובנים. נדיר מאוד שאורגניזם מת הופך למאובן. ראשית, האורגניזם צריך למות באזור הנכון. באזור זה בטח יש מים כלשהם עם משקעים כמו בוץ או חימר, או שיש לשמור על האורגניזם ב זפת, ענבר או קרח. ואז גם אם הוא נמצא במיקום הנכון, לא מובטח שהוא יתאובן. יש צורך בלחץ עז ולחץ לאורך פרקי זמן ארוכים מאוד כדי לעטוף את האורגניזם בתוך סלע משקע שיהפוך בסופו של דבר למאובנים. כמו כן, רק חלקים קשים בגוף כמו עצמות ושיניים מסייעים לשרוד תהליך זה להיות מאובן.
אפילו אם אכן נוצר מאובן של אורגניזם מעבר, מאובן זה עשוי לא לשרוד שינויים גיאולוגיים בכדור הארץ לאורך זמן. סלעים נשברים ללא הרף, נמסים ומשנים אותם לסוגים שונים של סלעים במחזור הסלע. זה כולל כל סלעי משקע שהיו אולי מאובנים בהם בפעם אחת.
כמו כן, שכבות סלע מונחות זו על גבי זו. חוק הסופרפוזיציה קובע כי שכבות הסלע הישנות יותר נמצאות בתחתית הערימה, בעוד שהחדשות יותר או שכבות צעירות יותר של סלע משקע המונחות על ידי כוחות חיצוניים כמו רוח וגשם קרובים יותר ל חלק עליון. בהתחשב בכמה מאובני המעבר שטרם נמצאו הם בני מיליוני שנים, יכול להיות שהם עדיין לא נמצאו. מאובני המעבר יכולים להיות שם עדיין, אבל מדענים פשוט לא חפרו עמוק מספיק כדי להגיע אליהם. מאובני מעבר אלה עשויים להימצא גם באזור שטרם נחקר ונחפר. עדיין קיימת אפשרות שמישהו עדיין יגלה את "הקישורים החסרים" הללו ככל שיותר מכדור הארץ נבדק על ידי פליאונטולוגים וארכיאולוגים בשדה.
הסבר אפשרי נוסף לחוסר במאובני מעבר יהיה אחת ההשערות באשר לאופן מהיר של האבולוציה. בעוד דארווין טען שההתאמות והמוטציות הללו התרחשו ונבנו באטיות בתהליך שנקרא הדרגתיותמדענים אחרים מאמינים ברעיון שינויים גדולים שהתרחשו בבת אחת בפתאומיות, או שניקבו שיווי משקל. אם נכון דפוס האבולוציה הוא שיווי משקל מנוקד, אז לא יהיו אורגניזמים מעבר שיעזבו מאובני מעבר. לפיכך, "החוליה החסרה" האגדית לא הייתה קיימת והטיעון הזה נגד האבולוציה כבר לא יהיה תקף.