קהילות ימיות הן בתי הגידול העיקריים בעולם למים. כמו ביו-אדמה, ניתן לחלק את הקהילות המימיות גם על פי מאפיינים משותפים. שני ייעודים נפוצים הם קהילות מים מתוקים וים.
קהילות מים מתוקים
נהרות ונחלים הם גופי מים הנעים ברציפות לכיוון יחיד. שתיהן קהילות המשתנות במהירות. מקור הנהר או הנחל בדרך כלל שונה משמעותית מהנקודה בה מתרוקן הנהר או הנחל. בקהילות מים מתוקים אלה ניתן למצוא מגוון של צמחים ובעלי חיים, כולל פורל, אצות, ציאנובקטריה, פטריותוכמובן מינים שונים של דגים.
שפכים הם האזורים שבהם נחלי מים או נהרות פוגשים את האוקיאנוס. אזורים מאוד פרודוקטיביים מכילים חיי צמחים ובעלי חיים מגוונים. הנהר או הנחל בדרך כלל נושאים חומרים תזונתיים רבים ממקורות יבשתיים, מה שהופך שפכי נחל המסוגלים לתמוך במגוון עשיר זה ובפרודוקטיביות גבוהה. שפכים מהווים זינה וגידול רב של בעלי חיים, כולל עופות מים, זוחלים, יונקים, ודו חיים.
אגמים ובריכות הם גופי מים עומדים. נחלים ונהרות רבים מסתיימים באגמים ובבריכות. פיטופלנקטון נמצא בדרך כלל בשכבות העליונות. מכיוון שאור נקלט רק לעומקים מסוימים, פוטוסינתזה שכיח רק בשכבות העליונות. אגמים ובריכות תומכים גם במגוון חיי צמחים ובעלי חיים, כולל דגים קטנים, שרימפס מלוחים, חרקים מימיים, ומינים רבים של צמחים.
קהילות ימיות
אוקיינוסים מכסים כ 70% משטח כדור הארץ. קשה לחלק את היישובים הימיים לסוגים נבדלים אך ניתן לסווג אותם על פי מידת חדירת האור. הסיווג הפשוט ביותר מורכב משני אזורים מובחנים: ה- צילום ו אפוטי אזורים. אזור הצילום הוא אזור האור או האזור משטח המים למעמקים בהם עוצמת האור היא רק סביב אחוז אחד מזה שבשטח. פוטוסינתזה מתרחשת באזור זה. הרוב המכריע של חיי הים קיימים באזור הצילום. האזור האפוטי הוא אזור שמקבל מעט שמש או ללא אור שמש. הסביבה באזור זה חשוכה וקרה במיוחד. אורגניזמים החיים באזור האפוטי לרוב הם bioluminescent או הם קיצוניים ומוכנים לחיות בסביבות קיצוניות. בדומה לקהילות האחרות, אורגניזמים חיים באוקיינוס. חלקם כוללים פטריות, ספוגים, כוכב ים, כלניות ים, דגים, סרטנים, דינופלגלטים, אצות ירוקות, יונקים ימיים, ואצות ענקיות.