קשרים גליקוזידיים מסומנים על פי זהות האטום על הפחמימה השנייה או הקבוצה התפקודית. הקשר הנוצר בין ההמיאטלטל או המדיקטל על הפחמימה הראשונה לקבוצת ההידרוקסיל על המולקולה השנייה הוא קשר O- גליקוזידי. ישנם גם קשרים N-, S- ו- C-glycosidic. קשרים קוולנטיים בין ההמיאטלטל או המדיקטל ל- -SR יוצרים תיוגליקוזידים. אם הקשר הוא ל- SeR, אז נוצרים selenoglycosides. איגרות החוב ל- -NR1R2 הן N- גליקוזידים. איגרות חוב ל- -CR1R2R3 נקראות C- גליקוזידים.
התנאי aglycone מתייחס לכל ROH תרכובת ממנו הוסרה שארית פחמימות, בעוד שאפשר לכנות את שאריות הפחמימות כ גליקון. מונחים אלה מיושמים לרוב על גליקוזידים המופיעים באופן טבעי.
ניתן לציין גם את כיוון הקשר. α- ו קשרים β-גליקוזידים מבוססים על מרכז התאים הרחוק ביותר מסכריד C1. קשר α-גליקוזידי מתרחש כאשר שתי הפחמימות חולקות את אותה סטריאו-כימיה. קשר gly-גליקוזידי נוצר כאשר לשני הפחמימות יש סטראוכימיה שונה.