בין 1336 ל- 1573 שלט שוגונאט אשיקאגה יפן. עם זאת, זה לא היה כוח שלטון מרכזי חזק, ולמעשה, אשיקאגא באקו היה עד לעליית הכוח daimyo בכל רחבי הארץ. לורדים אזוריים אלה שלטו על תחומיהם במעט מאוד התערבות או השפעה מצד המדינה שוגון בקיוטו.
ראשית שלטון אשיקאגה
המאה הראשונה לשלטון אשיקאגה נבדלת על ידי פריחה של תרבות ואומנויות, כולל דרמת נוח, וכן הפופולריות של זן בודהיזם. עד לתקופת אשיקאגה המאוחרת, יפן ירדה לתוהו ובוהו של האי סנגוקו התקופה, כאשר דיימיו שונים נלחמו זה בזה על שטח וכוח במלחמת אזרחים בת מאה שנים.
שורשי הכוח של אשיקאגה חוזרים עוד לפני תקופת קמאקורה (1185 - 1334) שקדם לשוגונאט של אשיקאגה. בתקופת קמאקורה נשלטה יפן על ידי סניף של שבט טיירה הקדומה, שאיבד את ה מלחמת ג'נפי (1180 - 1185) לשבט שבט מינמוטו, אך בכל מקרה הצליחו לתפוס את השלטון. האשיקאגה, בתורו, היה סניף של שבט מינמוטו. בשנת 1336, אשיקאגה טקוג'י הפיל את השוגונאט של קמקורה, למעשה הביס את הטיירה פעם נוספת והחזיר את המינמוטו לשלטון.
Ashikaga קיבל את ההזדמנות שלו בחלק גדול בזכות קובלאי חאןהקיסר המונגולי שייסד את שושלת יואן בסין. השניים של קובלאי חאן
פלישות יפן, ב 1274 ו- 1281, לא הצליחו בזכות נס ה קמיקזהאבל הם אכן החלישו משמעותית את שוגונאט קמאקורה. חוסר שביעות רצון הציבור משלטון קמקורה העניק לחמולת אשיקאגה את ההזדמנות להפיל את השוגון ולתפוס את השלטון.בשנת 1336 הקים אשיקאגה טקוג'י שוגונאט משלו בקיוטו. Shogunate Ashikaga ידוע לפעמים גם בשם השוגונט של מורומאצ'י מכיוון שארמון השוגון היה ברובע מורומאצ'י בקיוטו. מלכתחילה, שליטת אשיקאגה הוטתה על ידי מחלוקת. מחלוקת עם הקיסר, גו-דייגו, לגבי מי שיהיה לו באמת כוח, הביאה לכך שהקיסר הודח לטובת הקיסר קומיו. גו-דייגו נמלט דרומה והקים בית משפט קיסרי יריב משלו. התקופה שבין 1336 ל- 1392 ידועה כעידן בתי המשפט הצפוניים והדרומיים מכיוון שביפן היו שני קיסרים בו זמנית.
מבחינת היחסים הבינלאומיים, השוגונים של אשיקאגה שלחו למשימות דיפלומטיות ומסחר תכופות ז'וזון קוריאה, וגם השתמש בדאימיו של אי צושימה כמתווך. מכתבי אשיקאגה הופנו ל"מלך קוריאה "מ"מלך יפן", והצביעו על קשר שווה. יפן ניהלה גם קשרי סחר פעילים עם מינג סין, לאחר שהושלכה שושלת יואן המונגולית בשנת 1368. של סין קונפוציאני הסלידה מהסחר הכתיבה שהם מסווים את המסחר כ"מחווה "שמגיעה מיפן, בתמורה ל"מתנות" מהקיסר הסיני. גם אשיקאגא יפן וגם ז'וזון קוריאה הקימו קשר יובל זה עם מינג סין. יפן סחרה גם עם דרום מזרח אסיה, שלחה נחושת, חרבות ופרוות תמורת עצים ותבלינים אקזוטיים.
שושלת אשיקאגה הופלה
בבית, לעומת זאת, השוגונים של אשיקאגא היו חלשים. לשבט לא היה תחום בית גדול משל עצמו, כך שהיה חסר את העושר והכוח של הקאמקורה או המאוחרים שוגונים של טוקוגאווה. ההשפעה המתמשכת של תקופת אשיקאגה היא על האמנות והתרבות של יפן.
במהלך תקופה זו המעמד הסמוראי אימץ בהתלהבות את הזן בודהיזם, שיובא מסין כבר במאה השביעית. האליטות הצבאיות פיתחו אסתטיקה שלמה על בסיס רעיונות זן על יופי, טבע, פשטות ותועלת. אמנויות הכוללות טקס התה, ציור, עיצוב גנים, אדריכלות ועיצוב פנים, סידור פרחים, שירה ותיאטרון נוח, התפתחו לאורך כל זן.
בשנת 1467 פרצה מלחמת האונין בת העשור. עד מהרה הוא הסלים למלחמת אזרחים ארצית, כאשר דמיו שונים נלחמו על הפריבילגיה למנות את היורש הבא של כס השוגונל באשיקאגה. יפן פרצה ללחימה פלגית; הבירה הקיסרית והשוגונאלית של קיוטו בערה. מלחמת האונין סימנה את תחילתו של סנגוקו, תקופה של מאה שנה של מלחמת אזרחים ותהפוכות בלתי פוסקות. האשיקאגה המשיכה לשלטון באופן רשמי עד 1573, אז שליט אודה נובונאגה הפיל את השוגון האחרון, אשיקאגה יושיאקי. עם זאת, כוחה של אשיקאגה באמת הסתיים עם תחילת מלחמת האונין.