מהו פפטיד? הגדרה ודוגמאות

פפטיד הוא א מולקולה המורכב משניים או יותר חומצות אמינו מקושרים יחד על ידי קשרי פפטיד. המבנה הכללי של חומצת אמינו הוא: R-CH (NH₂) COOH. כל חומצת אמינו היא א מונומר שיוצר שרשרת פולימרית פפטיד עם חומצות אמינו אחרות כאשר קבוצת קרבוקסיל (-COOH) של חומצת אמינו אחת מגיבה עם קבוצת האמינו (-NH₂) של חומצה אמינית אחרת ויוצרת א קשר קוולנטי בין שאריות חומצות האמינו לשחרור מולקולת מים.

Takeaways מפתח: פפטידים

פפטידים הם מולקולות חשובות מבחינה ביולוגית ומדינית. הם מופיעים באופן טבעי בתוך אורגניזמים, בנוסף לכך שתרכובות מסונתזות במעבדה פעילות כאשר מוחדרים לגוף. פפטידים פועלים כמרכיבים מבניים של תאים ורקמות, הורמונים, רעלים, אנטיביוטיקה ואנזימים. דוגמאות לפפטידים כוללות את ההורמון אוקסיטוצין, גלוטתיון (מגרה צמיחת רקמות), מליטין (ארס דבורת הדבש), ההורמון האינסולין הלבלב וגלוקגון (גורם היפרגליקמי).

ריבוזומים בתאים בונים פפטידים רבים, שכן RNA מתורגם לרצף של חומצות אמינו והשאריות מקושרות זו לזו. ישנם גם פפטידים לא-ריבוזומליים, אשר בנויים על ידי אנזימים ולא על ידי ריבוזומים. בשני המקרים, ברגע שקשרו בין חומצות אמינו, הן עוברות שינויים לאחר הניתוח. אלה עשויים לכלול הידרוקסילציה, סולפונציה, גליקוזילציה וזרחן. בעוד שמרבית הפפטידים הם מולקולות ליניאריות, יש כאלה שיוצרים טבעות או מבני lariat. לעתים קרובות פחות, חומצות אמינו L עוברות גזענות ליצירת חומצות אמיניות D בתוך פפטידים.

המונחים "פפטיד" ו"חלבון "מבולבלים לרוב. לא כל הפפטידים יוצרים חלבונים, אך כל החלבונים מורכבים מפפטידים. חלבונים הם פפטידים גדולים (פוליפפטידים) המכילים 50 או יותר חומצות אמינו או מולקולות המורכבות ממספר יחידות משנה של פפטיד. כמו כן, חלבונים בדרך כלל מציגים יותר מבנה מורכב מאשר פפטידים פשוטים יותר.

ניתן לסווג את הפפטידים לפי תפקידם או לפי מקורם. ספר היד של פפטידים פעילים ביולוגית מפרט קבוצות של פפטידים, כולל:

• פפטידים אנטיביוטיים
• פפטידים חיידקיים
• פפטידים במוח
• פפטידים לסרטן ולסרטן
• פפטידים קרדיווסקולריים
• פפטידים אנדוקריניים
• פפטידים פטרייתיים
• פפטידים במערכת העיכול
• פפטידים חסרי חוליות
• פפטידים מחמירים
• צמח פפטידים
• פפטידים כלייתיים
• פפטידים נשימתיים
• פפטידים חיסונים
• פפטידים ארס

פפטידים נקראים על פי כמה שאריות חומצות אמינו שהם מכילים או לפי תפקידם:

• מונופפטיד: מורכב מחומצת אמינו אחת
• דיפפטיד: מורכב משתי חומצות אמינו
• טריפפטיד: יש שלוש חומצות אמינו
• טטרפפטיד: יש ארבע חומצות אמינו
• פנטפפטיד: יש חמש חומצות אמינו
• הקסאפפטיד: יש שש חומצות אמינו
• הפפטפטיד: יש שבע חומצות אמינו
• אוקטפפטיד: יש שמונה חומצות אמינו
• נונאפפטיד: יש תשע חומצות אמיניות
• דקאפפטיד: יש עשר חומצות אמינו
• אוליגופפטיד: מורכב בין שתיים לעשרים חומצות אמינו
• פוליפפטיד: שרשרת ליניארית של חומצות אמינו רבות הקשורות בקשרים אמיד או פפטיד
• חלבון: או מורכב מיותר מ -50 חומצות אמינו או מספר רב של פוליפפטידים
• ליפופפטיד: מורכב מפפטיד הקשור לליפיד
• נוירופפטיד: כל פפטיד הפעיל ברקמות עצביות
• סוכן פפטידרגי: כימי שמווסת את תפקוד הפפטידים
• חלבון: פפטידים המיוצרים על ידי הידרוליזה של חלבונים

שני סוגים של פפטידים מסווגים כחומרים אסורים על פי לוח 2 (S2) בסוכנות העולמית לסמים נגד סמים (WADA) רשימת האסורים, הסוכנות למניעת סמים בארצות הברית (USADA), רשימת האסורים על ידי ארצות הברית, ועל ידי האנטי-סימום הסמים האוסטרלי לספורט סמכות. הורמוני פפטיד ופפטידים מזכירים אסורים לשימוש על ידי ספורטאים מקצועיים, בין אם הם מתחרים ובין אם לא, מכיוון שהכימיקלים משמשים כמגביר ביצועים. הפפטידים האסורים הם הורמוני גדילה, אלה המגבירים את חמצון הדם, אלה המשפיעים על השרירים צמיחה ותיקון וכאלה שגורמים לאיברי מערכת אנדוקרינית (למשל, שחלות, אשכים, בלוטת התריס) להפריש הורמונים. החומרים אסורים לא רק מכיוון שהם יכולים להעניק לספורטאים יתרון לא הוגן על פני בני גילם, אלא מכיוון שהשימוש בהם יכול להעלות את הסיכון ליתר לחץ דם, שיכרון מים, נזק ללב וכבד וסרטן.

• אבא ג'. קסטין, עורכת (2013). ספר יד של פפטידים פעילים ביולוגית (מהדורה שנייה). ISBN 978-0-12-385095-9.
• ארדג'אני, מזיאר ש.; אורנר, ברנדן פ. (2013-05-03). "ציית לתקנות אסיפת הפפטיד". מדע. 340 (6132): 561–562. doi:10.1126 / מדע.1237708
• Finking R, Marahiel MA; Marahiel (2004). "ביוסינתזה של פפטידים לא-ריבוזומלים". סקירה שנתית של מיקרוביולוגיה. 58 (1): 453–88. doi:10.1146 / annurev.micro.58.030603.123615
• IUPAC. קומפנדיום לטרמינולוגיה כימית, מהדורה שנייה ("ספר הזהב"). הידור א. ד. מקנובה 'וא'. וילקינסון. פרסומי Blackwell Scientific, אוקספורד (1997). ISBN 0-9678550-9-8.