פטריות הן אורגניזמים אוקריוטים, כמו צמחים ובעלי חיים. בניגוד לצמחים, הם אינם מבצעים ביצועים פוטוסינתזה ויש להם צ'יטין, נגזרת של גלוקוז, בדפנות התא שלהם. כמו בעלי חיים, פטריות הן הטרוטרופיםמה שאומר שהם משיגים את החומרים התזונתיים שלהם על ידי ספיגתם.
למרות שרוב האנשים חושבים שהבדל אחד בין בעלי חיים לפטריות הוא שפטריות אינן ניעות, פטריות מסוימות הינן תנועה. ההבדל האמיתי הוא שפטריות מכילות מולקולה הנקראת בטא-גלוקן, סוג של סיבים, בדפנות התא שלהן.
בעוד שכל הפטריות חולקות כמה מאפיינים משותפים, ניתן לחלק אותן לקבוצות. עם זאת, מדענים החוקרים פטריות (מיקולוגים) חולקים על המבנה הטקסונומי הטוב ביותר. סיווג הדיוט הפשוט הוא לחלק אותם לפטריות, שמרים ותבניות. מדענים נוטים להכיר בשבע תת-ממלכות או תפילות של פטריות.
בעבר, פטריות סווגו לפי פיזיולוגיה, צורתם וצבעם. מערכות מודרניות מסתמכות על גנטיקה מולקולרית ואסטרטגיות רבייה כדי לקבץ אותן. זכור כי הפילה הבאה איננה מצויה באבן. המיקולוגים אפילו לא מסכימים לגבי שמות המינים
הפטריות המוכרות ביותר שייכות כנראה לתת-הדום דיקריה, הכולל את כל הפטריות, רוב הפתוגנים, השמרים והתבניות. תת-תחום
דיקריה נשבר לשתי תפילות, אסקומיקוטה ו Basidiomycota. תפילות אלה וחמשת האחרות שהוצעו, מבדילות בעיקר על בסיס מבני רבייה מינית.הפילום הגדול ביותר של פטריות הוא אסקומיקוטה. פטריות אלה נקראות ascomycetes, או פטריות שק מכיוון שנקבוביות המיוטיות שלהן (אסקוספוריות) נמצאות בשק הנקרא מיימת. פילום זה כולל שמרים חד-תאיים, חזזיות, תבניות, כמהין, פטריות נימה רבות, וכמה פטריות. פילום זה תורם פטריות המשמשות להכנת בירה, לחם, גבינה ותרופות. דוגמאות מכילות אספרגילוס ו פניציליום.
פטריות המועדון, או basidiomycetes, השייכים לפילה Basidiomycota לייצר basidiospores על מבנים בצורת מועדון בשם Basidia. הפילום כולל פטריות שכיחות ביותר, פטריות זרעים וחלודה. פתוגנים דגנים רבים שייכים לפילום זה. Cryptococcus neoformans הוא טפיל אנושי אופורטוניסטי. Ustilago maydis הוא פתוגן תירס.
פטריות השייכות לפילום Chytridiomycota נקראים צ'יטרידים. הם אחת הקבוצות הבודדות של פטריות עם תנועה אקטיבית, ומייצרות נבגים הנעים בעזרת סגל בודד. Chytrids מקבלים חומרים מזינים על ידי השפלת צ'יטין וקרטין. חלקם טפילים. דוגמאות מכילות Batrachochytrium dendobatidis, הגורם למחלה זיהומית המכונה דלקת כבד (Chytridiomycosis) אצל דו חיים.
סטיוארט, ש. נ.; שאנסון ג'. ש.; et al. (2004). "סטטוס ומגמות של ירידות והכחדות דו-חיים ברחבי העולם." מדע. 306 (5702): 1783–1786.
חברי הפילום Blastocladiomycota הם קרובי משפחה קרובים לקצוצים. למעשה, הם נחשבו כשייכים לפילום לפני שהנתונים המולקולריים הובילו אותם להיות נפרדים. Blastocladiomycetes הם רקמות ניזונות הניגרים מפירוק של חומר אורגני, כמו אבקה וציטין. חלקם טפילים של אאוקריוטות אחרות. בעוד שהקיטרידים מסוגלים למיוזה זיגוטית, הבלסטוקלדיומיציטים מבצעים מיוזה ספורית. חברי תצוגת הפילום חילופי דורות.
דוגמאות לכך הן Allomyces macrogynus, Blastocladiella emersonii, ו Physoderma maydis.
הפילום מיקרוספרידיה מכיל פטריות הנוצרות טפילים חד-תאיים. טפילים אלה מדביקים בעלי חיים ומפגינים, אורגניזם חד תאי. אצל בני אדם, הזיהום נקרא microsporidiosis. הפטריות מתרבה בתא המארח ומשחררות תאים. שלא כמו מרבית התאים האוקריוטים, במיקרוספורודידיה חסר מיטוכונדריה. אנרגיה מופקת במבנים הנקראים מיטוזומים. מיקרוספרידידיה אינן תנועה.
Neocallimastigomycetes שייכים לפילה Neocallimastigomycota, פילום קטן של פטריות אנאירוביות. אורגניזמים אלה חסרי מיטוכונדריה. במקום זאת, התאים שלהם מכילים מימן. הם יוצרים זואוספוריות זזות שיש להן דגל אחד או יותר. פטריות אלה נמצאות בסביבות עשירות תאית, כמו מערכות העיכול של אוכלי עשב או במזבלות. הם נמצאו גם אצל בני אדם. אצל מתלים, הפטריות ממלאות תפקיד חיוני בעיכול הסיבים.
אורגניזמים אחרים נראים ופועלים כמו פטריות ועם זאת אינם חברים בממלכה. תבניות רפש אינן נחשבות לפטריות מכיוון שאין להן תמיד דופן תא ומכיוון שהן נוטלות חומרים מזינים ולא סופגות אותם. תבניות מים והיפוכיטרידים הם אורגניזמים אחרים שנראים כמו פטריות אך עדיין אינם מסווגים איתם.