1) הוקקאידו
שטח: 32,221 מיילים (83,452 קמ"ר)
בירה: סאפורו
2) איוואטה
שטח: 15,878 מ"ר
בירה: מוריוקה
3) פוקושימה
שטח: 5,321 מיילים (13,782 קמ"ר)
בירה: עיר פוקושימה
4) נגאנו
שטח: 4,864 מיילים (12,598 קמ"ר)
בירה: נגאנו
5) ניגטה
שטח: 4,857 מיילים (12,582 קמ"ר)
בירה: נייגטה
6) אקיטה
שטח: 4,483 מיילים (11,612 קמ"ר)
הון: אקיטה
7) גיפו
שטח: 4,092 מיילים (10,598 קמ"ר)
הון: גיפו
8) אומורי
שטח: 3,709 מ"ר (9,606 קמ"ר)
בירה: אומורי
9) יאמגטה
שטח: 3,599 מ"ר (9,323 קמ"ר)
בירה: יאמגטה
10) קגושימה
שטח: 3,526 מ"ר (9,132 קמ"ר)
בירה: קגושימה
11) הירושימה
שטח: 3,477 מיילים (8,477 קמ"ר)
בירה: הירושימה
12) היוגו
שטח: 3,240 מיילים (8,392 קמ"ר)
בירה: קובי
13) שיזואוקה
שטח: 2,829 מיילים (7,328 קמ"ר)
בירה: שיזואוקה
14) מיאגי
שטח: 7,885 קמ"ר
עיר בירה: סנדאי
15) קוצ'י
שטח: 2,743 מיילים (7,104 קמ"ר)
הון: קוצ'י
16) אוקייאמה
שטח: 2,706 מיילים (7,008 קמ"ר)
בירה: אוקייאמה
17) קוממוטו
שטח: 2,667 מיילים (6,908 קמ"ר)
בירה: קוממוטו
18) שימנה
שטח: 2,589 מ"ר (6,707 קמ"ר)
בירה: Matsue
19) מיאזאקי
שטח: 2,581 מ"ר (6,684 קמ"ר)
בירה: מיאזאקי
20) טוצ'יגי
שטח: 2,474 מיילים (6,408 קמ"ר)
בירה: Utsunomiya
21) גונמה
שטח: 2,457 מיילים (6,363 קמ"ר)
בירה: מעבשי
22) ימאגוצ'י
שטח: 2,359 מיילים (6,111 קמ"ר)
בירה: ימאגוצ'י
23) איבראקי
שטח: 2,353 מיילים (6,095 קמ"ר)
בירה: מיטו
24) אויטה
שטח: 2,241 מיילים (5,804 קמ"ר)
הון: אויטה
25) מיי
שטח: 2,224 מיילים (5,761 קמ"ר)
בירה: Tsu
26) אהימה
שטח: 2,191 מיילים (5,676 קמ"ר)
בירה: Matsuyama
27) צ'יבה
שטח: 1,991 מיילים (5,156 קמ"ר)
בירה: צ'יבה
28) איצ'י
שטח: 1,990 מיילים (5,154 קמ"ר)
בירה: נגויה
29) פוקואוקה
שטח: 1,919 מיילים (4,971 קמ"ר)
בירה: פוקואוקה
30) וואקאיאמה
שטח: 1,824 מיילים (4,725 קמ"ר)
בירה: וואקאיאמה
31) קיוטו
שטח: 1,781 מיילים (4,613 קמ"ר)
בירה: קיוטו
32) ימנאשי
שטח: 1,724 מיילים (4,465 קמ"ר)
הון: קופו
33) טויאמה
שטח: 1,640 מיילים (4,247 קמ"ר)
בירה: טויאמה
34) פוקוי
שטח: 1,617 מיילים (4,189 קמ"ר)
בירה: פוקוי
35) אישיקאווה
שטח: 1,616 מיילים (4,185 קמ"ר)
בירה: קאנאזאווה
36) טוקושימה
שטח: 1,600 מיילים (4,145 קמ"ר)
בירה: טוקושימה
37) נגסאקי
שטח: 1,580 מיילים (4,093 קמ"ר)
בירה: נגסאקי
38) שיגה
שטח: 1,551 מיילים (4,017 קמ"ר)
הון: אוטסו
39) סייטאמה
שטח: 1,454 מיילים (3,767 קמ"ר)
בירה: סייטאמה
40) נארה
שטח: 1,425 מיילים (3,691 קמ"ר)
בירה: נארה
41) טוטורי
שטח: 1,354 מיילים (3,507 קמ"ר)
בירה: טוטורי
42) סאגה
שטח: 942 מ"ר (2,439 קמ"ר)
בירה: סאגה
43) קנגאווה
שטח: 932 מ"ר (2,415 קמ"ר)
בירה: יוקוהמה
44) אוקינאווה
שטח: 2,271 קמ"ר
הון: נהה
45) טוקיו
שטח: 844 מ"ר (2,187 קמ"ר)
בירה: שינג'וקו
46) אוסאקה
שטח: 1,893 ק"מ רבועים
בירה: אוסאקה
47) קאגאווה
שטח: 1,862 קמ"ר
בירה: טאקאמאטסו
מקורות:
Wikipedia.org. מחוזות יפן - ויקיפדיה, האינציקלופדיה החופשית. נלקח מ: http://en.wikipedia.org/wiki/Prefectures_of_Japan.