עבור חלק גדול מהעיירות הפליאוזואית, המזוזואית והקנוזואית, מדינת מינסוטה הייתה מתחת למים - מה שמסביר את האורגניזמים הימיים הקטנים הרבים מהתקופה קמבריאנית ו אורדובי תקופות, ומיעוטם היחסי של המאובנים שהשתמרו מתקופת הדינוזאורים. בשקופיות הבאות תגלו את הדינוזאורים והחיות הפרהיסטוריות החשובות ביותר שהתגלו במינסוטה. (לראות רשימת דינוזאורים ובעלי חיים פרהיסטוריים שהתגלו בכל מדינה בארה"ב.)
למרות קרבתו למדינות עתירות דינוזאורים כמו דקוטה הדרומית ונברסקה, מעט מאוד מאובני הדינוזאורים התגלו במינסוטה. עד היום החוקרים מצאו רק את העצמות המפוזרות והמפוצצות של מין לא מזוהה Hadrosaur, או דינוזאור שטוח ברווז, שכנראה נדד ממערב יותר. (כמובן, בכל מקום בו גרו הרזזאורים, בהחלט היו כאלה שודדים ו טירנוזאורים כמו כן, אך הפליאונטולוגים טרם הציגו הוכחות מאובנות ישירות כלשהן - למעט מה שנראה כמו טופר של ראפטור, שהתגלה בקיץ 2015).
זה היה רק לקראת סוף העידן הקנוזואי - בתקופת המלחמה פליסטוקן תקופה, שהתחילה לפני כשני מיליון שנה - שמינסוטה אירחה באמת שפע של חיים מאובנים. כל מיני יונקים מגפאונה התגלו במדינה זו, כולל ביברים בגודל ענק, גיריות, בואש ואיילים, כמו גם המוכרים יותר
ממותה צמרירית ו מסטודון אמריקאי. כל החיות הללו נפטרו בעקבות תקופת הקרח האחרונה, לפני כ -10,000 עד 8,000 שנה, וייתכן מאוד שהן נתקלו בראשית הילידים באמריקה.במינסוטה יש כמה מהמשקעים העתיקים ביותר בארצות הברית; מדינה זו עשירה במיוחד במאובנים מימי המדינה אורדובי לפני כ -500 עד 450 מיליון שנה, והיא אפילו הניבה עדויות לחיים ימיים עד לתקופה הפרה-קומבריאנית (כאשר החיים המורכבים-תאים המורכבים כפי שאנו מכירים הם טרם עשו להתפתח). כפי שניחשו לנחש, בעלי חיים אז לא היו מתקדמים במיוחד, ומורכבים ברובם מטרילוביטים, ברכיפודים ויצורים ימיים קטנים אחרים.