ישנם כמה הבדלים וכמה קווי דמיון בין RNA קטן המפריע (siRNA) למיקרו RNA (miRNA). ה- SiRNA עם החוט הכפול עשוי להיות ידוע גם כ- RNA המפריע קצר או RNA משתיק. RNA מיקרו הוא מולקולה שאינה מקודדת. חומצה ריבונוקליאית (RNA) נחוצה לקידוד ביולוגי ולביטוי גנים בכל היצורים החיים.
מהם siRNA ו- miRNA?
לפני שתוכלו להבין את הדרכים שבהן siRNA ו- miRNA דומים וכיצד הם שונים, זה עוזר לדעת בדיוק מה הם. הן siRNA והן miRNA הם כלי פרוטאומיקה המשמשים לחקר היבטים שונים של ביטוי גנים. Proteomics הוא המחקר של חלבונים שבאמצעותם נבדק מיד השלמת החלבונים של התא. ההתקדמות הטכנולוגית איפשרה מחקר כזה.
אז האם siRNA ו- miRNA דומים או שונים? חבר המושבעים עדיין לא נמצא בשאלה זו, תלוי את מי שואלים. מקורות מסוימים סבורים כי siRNA ו- miRNA הם אותם דברים, בעוד שאחרים מצביעים על כך שהם ישויות נפרדות לחלוטין.
המחלוקת נוצרת משום ששניהם נוצרים באותו אופן. הם יוצאים ממבטי RNA ארוכים יותר. שניהם מעובדים גם בציטופלזמה על ידי אנזים קרא Dicer לפני שהוא הופך לחלק ממורכבות החלבונים RISC. אנזימים הם חלבונים שיכולים לשפר את קצב התגובה בין ביומולקולות.
ישנם הבדלים קלים בין השניים
התהליך של הפרעות RNA (RNAi) יכול להיות ממתון על ידי אחד מהם siRNA או מירנה, ויש הבדלים עדינים בין השניים. כאמור, שניהם מעובדים בתוך התא על ידי האנזים דיסר ומשולבים ב- RISC המורכב.
siRNA נחשב ל- RNA אקסוגני כפול גדילי שנלקח על ידי תאים. במילים אחרות, זה נכנס דרך וקטוריםכמו וירוסים. וקטורים נוצרים כאשר גנטיקאים משתמשים בפיסות DNA בכדי לשבט גן כדי לייצר אורגניזם מהונדס גנטית. ה- DNA המשמש בתהליך זה נקרא וקטור.
למרות שנחשב כי SiRNA הוא RNA אקסוגני כפול גדילי, miRNA הוא חד-גדילי. זה נובע מ- RNA אנדוגני שאינו מקודד, כלומר הוא מיוצר בתוך התא. RNA זה נמצא בתוך האינטרונים של מולקולות RNA גדולות יותר.
כמה הבדלים אחרים
הבדל נוסף בין siRNA למירנה הוא ש- siRNA בדרך כלל נקשר באופן מושלם למטרה ה- mRNA שלה בבעלי חיים. זה התאמה מושלמת לרצף. לעומת זאת, miRNA יכול לעכב את התרגום של רצפי mRNA רבים ושונים מכיוון שהזיווג שלו אינו מושלם. התרגום מתרחש לאחר שינוי ה- RNA של המסנג'ר ונקשר לאתר מסוים בריבוזום. בצמחים, miRNA נוטה להיות רצף משלים יותר בצורה מושלמת, מה שמשרה את המחשוף של mRNA לעומת דיכוי התרגום בלבד.
siRNA ו- miRNA יכולים שניהם למלא תפקיד באפיגנטיקה באמצעות תהליך המכונה השתקת תעתיק הנגרמת על ידי RNA (RITS). אפיגנטיקה היא מחקר של מידע גנטי מורש בו רצף הנוקלאוטידים של ה- DNA לא משתנה אלא מתבטא כסימנים כימיים. סימנים אלה מתווספים לחלבוני DNA או כרומטין לאחר שכפול. באופן דומה, שניהם מהווים יעדים חשובים לשימוש טיפולי בגלל התפקידים שהם ממלאים בביטוי הגן השולט.