תרכובות מולקולריות מכילות שתיים או יותר לא מתכות (לא יון האמוניום). בדרך כלל ניתן לזהות תרכובת מולקולרית מכיוון שהיסוד הראשון בשם המתחם הוא לא מתכתי. ישנם תרכובות מולקולריות המכילות מימן, עם זאת, אם אתה רואה תרכובת המתחילה ב- "H", אתה יכול להניח שהיא חומצה ולא תרכובת מולקולרית. תרכובות המורכבות רק מפחמן עם מימן נקראות פחמימנים. לפחמימנים יש שמות ייחודיים משלהם, ולכן הם מטופלים באופן שונה מתרכובות מולקולריות אחרות.
לא-מתכות עשויות להשתלב במגוון יחסים, ולכן חשוב ששמה של תרכובת מולקולרית יציין כמה אטומים מכל סוג של יסוד נמצאים במתחם. זה נעשה באמצעות קידומות. אם יש רק אטום אחד מהיסוד הראשון, לא נעשה שימוש בקידומת. נהוג לקדם את שמו של אטום אחד של היסוד השני עם מונו-. לדוגמה, CO נקרא פחמן חד חמצני ולא תחמוצת הפחמן.
אתה יכול לכתוב את הנוסחה לתרכובת קוולנטית משמה על ידי כתיבת הסמלים עבור האלמנטים הראשון והשני ותרגום הקידומות לתכנות המשנה. לדוגמה, קסנון הקספלואוריד ייכתב XF6. מקובל שלסטודנטים מתקשים לכתוב נוסחאות משמות של תרכובות שכן תרכובות יוניות ותרכובות קוולנטיות מבולבלות לרוב. אינך מאזן בין חיובי תרכובות קוולנטיות; אם המתחם אינו מכיל מתכת, אל תנסה לאזן את זה!