כמו כן, כמעט כל התרכובות האורגניות מכילות קשרי פחמן-מימן או C-H. שים לב ש אינו מכיל פחמן שתרכובת תיחשב אורגנית. חפש גם פחמן וגם מימן.
מולקולות הקשורות לאורגניזמים חיים הן אורגניות. אלה כוללים חומצות גרעין, שומנים, סוכרים, חלבונים, אנזימים ודלקים פחמימניים. כל המולקולות האורגניות מכילות פחמן, כמעט כולן מכילות מימן, ורבות מהן מכילות גם חמצן.
אורגניים כוללים מלחים, מתכות, חומרים העשויים מיסודות בודדים וכל תרכובות אחרות שאינן מכילות פחמן המלוכד למימן. כמה מולקולות אורגניות מכילות, למעשה, פחמן.
בעוד שרוב התרכובות האורגניות בהן נתקלות בכימיה מיוצרות על ידי אורגניזמים חיים, ייתכן שהמולקולות נוצרות באמצעות תהליכים אחרים.
לדוגמה, כאשר מדענים מדברים על מולקולות אורגניות שהתגלו על פלוטו, אין זה אומר שיש חייזרים בעולם. קרינת השמש יכולה לספק אנרגיה לייצור תרכובות אורגניות מתרכובות פחמן אורגניות.