על מנת שמינים שונים יתבדלו מאבות אבות משותפים ונסעו אבולוציה, בידוד רבייה חייב להתרחש. ישנם כמה סוגים של בידוד רבייה המובילים למיצוי. אחת השיטות הנפוצות ביותר היא בידוד פרה-גיזוטי שמתרחש לפני שהפריון מתרחש בין לבין גמטות ומונע מינים שונים מ רבייה מינית. בעיקרון, אם אנשים אינם יכולים להתרבות, הם נחשבים שונים מינים וסטות על עץ החיים.
ישנם כמה סוגים של בידוד פרה-גוגי שנע בין אי התאמה של גמטות להתנהגויות התוצאה היא חוסר תאימות, ואפילו סוג של בידוד שמעכב אנשים באופן פיזי רבייה.
בידוד מכני - חוסר התאמה של איברי המין - הוא ככל הנראה הדרך הפשוטה ביותר למנוע מאנשים להתרבות זה עם זה. בין אם מדובר בצורת אברי הרבייה, המיקום או הבדלי הגודל אוסרים על אנשים להתחבר, כאשר איברי המין אינם משתלבים זה בזה, אין זה אפשרי להזדווג להתרחש.
בצמחים הבידוד המכני עובד קצת אחרת. מכיוון שגודל וצורה אינם רלוונטיים להתרבות הצמח, בדרך כלל הבידוד המכני נובע משימוש במאביק שונה לצמחים. לדוגמה, צמח שמיועד אליו האבקת דבורים לא יהיה תואם לפרחים שמסתמכים עליהם יונקים להפיץ את האבקה שלהם. אמנם זה עדיין תוצאה של צורות שונות, אך לא צורת הגמטים האמיתיים היא החשובה, אלא חוסר ההתאמה של צורת הפרחים והמאביקים.
מינים שונים נוטים להיות בעונות רבייה שונות. העיתוי של מחזורי הפוריות הנשיות יכול לגרום לבידוד זמני. מינים דומים עשויים להיות תואמים פיזית, אך עדיין לא יתאבדו בגלל עונות ההזדווגות שלהם המתרחשות בתקופות שונות של השנה. אם הנקבות של מין אחד פוריות במהלך חודש נתון, אך הזכרים אינם מסוגלים להתרבות באותה תקופה של השנה, זה יכול להוביל לבידוד רבייה בין שני המינים.
לעיתים חופפות מעט עונות ההזדווגות של מינים דומים מאוד. זה נכון במיוחד אם המינים חיים באזורים שונים ולא משאירים סיכוי להכלאות. עם זאת, הוכח שמינים דומים שחיים באותו אזור בדרך כלל אינם כוללים שלבים של הזדווגות חופפות, גם אם הם מתרחשים בסביבות שונות. סביר להניח שמדובר באופי הסתגלות שנועד לצמצם את התחרות על משאבים ובני זוג.
סוג נוסף של בידוד פרגיגוטי בין מינים קשור להתנהגויות של הפרטים, ובמיוחד להתנהגויות סביב זמן ההזדווגות. גם אם שתי אוכלוסיות של מינים שונים תואמות מכנית וגם זמנית, הרי שלהן התנהגות טקסית של הזדווגות בפועל עשויה להספיק בכדי להשאיר את המין בבידוד רבייה מזה אחר.
טקסי הזדווגות, יחד עם התנהגויות זוגיות נחוצות אחרות - כגון שיחות וריקודים להזדווגות - נחוצים מאוד לזכרים ונקבות מאותו המין כדי לציין שהגיע הזמן להתרבות. אם טקס ההזדווגות נדחה או לא יוכר, אזי לא יתאפשר הזדווגות והמינים יתבודדו זה מזה באופן רבייה.
למשל, ה- כחול רגליים ציצית לציפור יש ריקוד הזדווגות משוכלל ביותר שעל הזכרים לבצע כדי לחזר את הנקבה. הנקבה תקבל או תדחה את התקדמות הזכר, עם זאת, מיני ציפורים אחרים שאין להם את אותו הדבר ריקוד ההזדווגות יתעלם לחלוטין מהנקבה - כלומר אין להם שום סיכוי להתרבות עם נקבה עם רגליים כחולות booby.
אפילו למינים קרובים מאוד יש העדפות לגבי מקום מגוריהם ואיפה הם מתרבים. לעיתים המיקומים המועדפים הללו לאירועי רבייה אינם תואמים בין המינים, מה שמוביל למה שמכונה בידוד גידול. ברור שאם יחידים משני מינים שונים לא גרים בשום מקום קרוב זה לזה, לא תהיה הזדמנות להתרבות. בידוד רבייה מסוג זה מוביל למבדק נוסף.
עם זאת, אפילו מינים שונים החיים באותה אזור עשויים שלא להיות תואמים בגלל מקום ההתרבות המועדף עליהם. יש כמה ציפורים שמעדיפות סוג מסוים של עץ, או אפילו חלקים שונים של אותו עץ, להטיל את ביציהן ולעשות את הקנים שלהן. אם מינים דומים של ציפורים נמצאים באזור, הם יבחרו במקומות שונים ולא יתערבבו. זה שומר על המין נפרד ואינו מסוגל להתרבות זה עם זה.
בידוד גנטי מבטיח שרק זרע מאותו המין יוכל לחדור לביצית של אותו מין ולא אחרים. במהלך ההתרבות המינית, הביצית הנקבית מתמזגת עם הזרע הזכר, ויחד הם יוצרים זיגוטה. אם הזרע והביצה אינם תואמים, הפריה לא יכולה להתרחש. בגלל כמה אותות כימיים שמשתחררים על ידי ביצה, ייתכן שהזרע אפילו לא נמשך אליו. גורם נוסף המונע היתוך הוא זרע שאינו יכול לחדור לביצה בגלל האיפור הכימי שלו. אחת הסיבות הללו מספיקה כדי לתסכל את האיחוי ולמנוע היווצרות של זיגוטה.
סוג זה של בידוד רבייה חשוב במיוחד למינים המתרבים חיצוניים במים. למשל נקבות מרבית מיני הדגים פשוט משחררות את ביציהן למים באזור הגידול המועדף עליהן. דגים זכריים מאותו מין באים לאחר מכן ומשחררים את זרעם מעל הביצים כדי להפרות אותם. אולם מכיוון שהדבר מתרחש בסביבה נוזלית, חלק מהזרע נסחף על ידי מולקולות מים ומתפזר. אלמלא היו קיימים מנגנוני בידוד גנטי, זרע כלשהו יכול היה להתמזג עם ביצה כלשהי, מה שיגרום להיברידיות מכל סוג שהוא במקרה הזדווג במים באותה תקופה.