המחשבה הראשונה עבור רבים כאשר הם חושבים על מלחמת האזרחים היא של הצבאות המסיביים שמתרחקים במקומות כמו שילה או גיטסבורג. בנוסף למאבק ביבשה, התרחש קרב לא פחות חשוב על הגלים. אוניות מלחמה של האיחוד כיתרו את חופי דרום, נחנקות כלכלית את הקונפדרציה ושללו מצבאותיה תחמושת ואספקה נחוצים. כדי להתנגד לכך, חיל הים הקונפדרציה הקטן שיחרר נחיל של פושעי מסחר במטרה לפגוע בסחר הצפוני ולגרור אוניות הרחק מהחוף.
משני הצדדים פותחו טכנולוגיות חדשות הכוללות חיפויי הברזל והצוללות הראשונות. מלחמת האזרחים הייתה באמת רגע מרכזי בלוחמה הימית, כשהיא מסמנת את סיום ספינות מפרש מעץ, אישרה את כוח הקיטור כאמצעי להנעה והולידה ספינות מלחמה משוריינות ומכוסות ברזל. גלריה זו תספק סקירה של כמה מהאוניות ששימשו במהלך המלחמה.
הושק בשנת 1842, קמברלנד נבנה במקור כפריגטה של 50 אקדחים. בשנת 1855 "הספינה" הספינה למפלס מלחמה כדי לאפשר לה לשאת את תותחי הקליפה החדשים ביותר של הצי. ב- 8 במרץ 1862, קמברלנד הוטבע בקרב על דרומי המפטון לאחר שנגח על ידי חיפוי הברזל הקונפדרציה החדש וירג'יניה(מרימרק). במהלך הקרב, קמברלנדאנשי הצוות התבוננו באימה כשפגזים שלהם קפצו מצידי הספינה המשוריינת, בעוד הקונפדרציה קרעה את שלהם. שקיעתו של
קמברלנד על ידי וירג'יניה סימן את סיום העידן בן מאות השנים של ספינות מלחמה מעץ מפרש.הוזמן בינואר 1862, על ידי ג'יימס אדס ושות ', USS קהיר היה אופייני לסירות התותחים עם חיפוי הברזל שהעסיק חיל הים האמריקני על הנהרות המערביים. מונע על ידי גלגל ההנעה הסגור (שימו לב לגבנון המעוקלת מאחור הערימות), USS קהיר היה ברשות טיוטה רדודה שאפשרה לו לתמרן ביעילות בתנאים המשתנים של מערכת נהר מיסיסיפי. לאחר שהשתתף במתקפות על כרית מבצר ועזרו באזור התבוסה של סירות הנשק הקונפדרציה מחוץ לממפיס, קהיר לקח חלק ב קמפיין ויקסבורג. ב- 12 בדצמבר 1862 פגעה הספינה במכרה ליד היינס בלוף, מ.ס., ושקעה תוך שתים עשרה דקות. קהירהשרידים הועלו בשנת 1964, והם מוצגים בגן הצבאי הלאומי של ויקסבורג.
נבנה בליברפול, אנגליה תחת השם אורטו, CSS פלורידה הועלה לשירות הקונפדרציה ב -17 באוגוסט 1863 עם סגן ג'ון נ. מפיט בפיקוד. במהלך שמונת החודשים הראשונים של 1863, פלורידה הטיל אימה על משלוח האיחוד באוקיאנוס האטלנטי וקריביים, ותפס 22 פרסים. פלורידה ואז המשיך לברסט, צרפת שם עבר שיפוץ ממושך. לאחר שהחזיר את הים לפברואר 1864, עם פיקודו של סא"ל צ'רלס מוריס, תפס התובע 11 אוניות נוספות של האיחוד לפני שהגיע לבהיה, ברזיל. בבהיה, פלורידה הותקף, נלכד ונגרר לים על ידי USS ואצ'וסט בעוד מוריס ורוב הצוות היו בחוף. אף כי הכיבוש התרחש בנמל ניטרלי והופיעה הפגנות, מעולם לא ננקטה שום פעולה ואצ'וסטהקפטן, מפקד נפוליאון קולינס. בנובמבר ההוא פלורידה שקע ליד המפטון רודס, וירג'יניה לאחר שנגרם בטעות על ידי הובלה. ככל שסיפר, הפשיט תפס 37 אוניות, שנייה בלבד ל CSS אלבמה.
מלחמת האזרחים הולידה מגוון עיצובים לספינות מלחמה טבולות. עוצב על ידי הוראס ל. האנלי, ג'יימס מקלינטוק ובקטר ווילסון צוללתH.L. Hunley נבנה באופן פרטי על ידי חברת פארקס אנד ליונס במובייל, אל. אורכו כארבעים רגל, H.L. Hunley הפליג עם צוות של שמונה והונע על ידי מדחף ארוע ביד. זמן קצר לאחר השלמת הבדיקה, H.L. Hunley נלקח לצ'רלסטון, SC, לשימוש נגד המצור על האיחוד. במהלך הניסויים בנמל צ'רלסטון, הצוללת שקעה פעמיים והרגה חמישה מצוותה בפעם הראשונה, ושמונה, כולל הוראס הונלי, השנייה. בליל ה- 17 בפברואר 1864 הפליג סא"ל ג'ורג 'דיקסון H.L. Hunley מחוץ לצ'רלסטון לתקוף את ארה"ב הוליטוני. צלילה כשהם התקרבו לספינה, צוות הצוות של H.L. Hunley חיבר ופוצץ בהצלחה את טורפדו הצילום של הצוללת (מטען נפץ בסוף חנית ארוכה). הפיצוץ שקע הוליטונימה שהופך אותו לקורבן הראשון אי פעם של מתקפת צוללת. למרות הצלחתה, H.L. Hunley אבד בים בניסיון לחזור לנמל. הרס הצוללת אותר בשנת 1995 וגדל חמש שנים לאחר מכן. כיום הוא עובר טיפול שימור בצ'רלסטון.
הוזמן בינואר 1862, ארה"ב מיאמי היה אופייני לסירות-הנשק "דו-אנדר" ששימשו את הצי האמריקני למצור על החוף הדרומי. הסוג הרוויח את שמו בזכות צורת הגולגולת שלהם, שאפשרה להם לנסוע במהירויות שוות קדימה או אחורה. תכונה זו הגבירה את יכולת התמרון שלהם, אשר בשילוב עם הדראפט הרדוד שלהם, הפכה אותם לאידיאליים לתפעול בחוף בין הצלילים והמים האקונומיים של הקונפדרציה. מיאמי ביליתי את רוב המלחמה שהוצבה בצלילי קרוליינה הצפונית וראה פעולה נגד חיפוי הברזל הקונפדרציה אלבמרל באפריל 1864.
עם ההצלחה של USS צגהצי האמריקני ביקש לייצר יותר אוניות מעיצוב דומה. שיפור על המקור, צגי ה- פסיאק-כלול כלל תכונות משופרות כמו בית טייס משוריין. הוזמן בפברואר 1863, ארה"ב נאנטוקטנשלח לצ'רלסטון שם השתתף בהתקפות נגד מבצרי הנמל. למרות השיפורים בעיצוב, נאנטוקט והאחר פסיאק-מוניטורי קלאס היו סירות ים עניים ומועדים לאותו סוג של ביצות ששקע בארה"ב צג. כתוצאה מכך חיל הים חילץ את פעילותו למי החוף.
למרות שהבנייה החלה בשנת 1862, CSS טנסי לא הושלם עד 1864, בגלל מחסור בחומרים. טנסיכמו רוב חוטי הברזל הקונפדרציה, הוצג מארז גדול ומשוריין לתותחיו המכונה kasemate. לראשונה נעשה שימוש בתכונת עיצוב זו CSS וירג'יניה בשנת 1862. מבוסס על הנייד, טנסי התארס את האדמירל דייוויד ג. צי האיחוד של פרגוט ליד העיר קרב מפרץ מובייל ב- 5 באוגוסט 1864. מול סיכויים מוחלטים, טנסי נלחם בגבורה עד שנחבט בכניעה ונאלץ להיכנע.
א אירוקואהמחרוזת בורג מעץ, USS ואצ'וסט היה אופייני לכלים ששימשו את חיל הים לאיחוד מחוץ לחוף הים ויירטו את פושעי המסחר הקונפדרטיים. הוזמן במרץ 1862, ואצ'וסט בתחילה שירת עם טייסת החסימה הצפונית האטלנטית לפני שהועבר לארץ מיוחד "טייסת המעופף". ארגון זה הוטל על מעקב ושריפת הקונפדרציה שודדים. בפברואר 1864 הוטל על הספינה באהיה שבברזיל עם הוראות להגנה על המסחר האמריקני באזור. אוקטובר ההוא ואצ'וסט נתקל בריידר CSS פלורידה בנמל בהיה. אם כי מבחינה טכנית במים ניטרליים, ואצ'וסטרב החובל, המפקד נפוליאון קולינס, הורה על התקפה. לתפוס פלורידה בהפתעה, גברים מ ואצ'וסט תפס במהירות את הספינה. לאחר שיפוץ קצר, ואצ'וסט קיבל הוראות להפליג למזרח הרחוק כדי לסייע במצוד אחר CSS שננדואה. זה היה בדרך עם קבלת הידיעה שהמלחמה הסתיימה.
אחת הספינות המפורסמות ביותר של מלחמת האזרחים, USS הרטפורד מוגש כ האדמירל דוד ג. פרגוטספינת הדגל למשך הסכסוך. בשנת 1862, הרטפורד הוביל צי איחוד על פני המבצרים ששמרו על ניו אורלינס וסייעו לו לכידת העיר. במשך השנה הבאה, פרגוט תיאמה עם כוחות האיחוד כדי לסייע בכיבוש מעוזי הקונפדרציה של ויקסבורג ו פורט הדסון. בשנת 1864, פרגוט העביר את המיקוד שלו להכניע את נמל מובייל. ב- 5 באוגוסט 1864 פרגוט ו הרטפורד השתתף ב קרב מפרץ מובייל, זכה בניצחון אדיר ופתח את העיר לכבוש על ידי כוחות האיחוד. הרטפורד נשאר בצי עד שנת 1956, אז פורק לאחר ששקע במעגן.