ראשית, החדשות הרעות: מעולם לא התגלו דינוזאורים במישיגן, בעיקר מכיוון שבמהלך התקופה התקופה המזוזואית, כשחיו הדינוזאורים, המשקעים במצב זה נשחקו בהתמדה על ידי טבעיים כוחות. (במילים אחרות, דינוזאורים אמנם גרו במישיגן לפני 100 מיליון שנה, אך לשרידים שלהם לא היה סיכוי להתאחד.) עכשיו החדשות הטובות: המדינה הזו עדיין ראוי לציון במאובנים מחיים פרהיסטוריים אחרים המתוארכים לתקופות הפליאוזואית והקנוזואית, כולל יצורים ייחודיים כמו ממותה צמרירית ואמריקאית מסטודון.
עד לא מזמן התגלו מעט מאוד מאובנים של יונקים מגפאונה במדינת מישיגן (למעט כמה לווייתנים פרהיסטוריים וחלקם שרידים מפוזרים של יונקים ענקיים מפליסטוקן). כל זה השתנה בסוף ספטמבר 2015, כאשר מערכת נרחבת להפליא של ממותה צמרירית העצמות נחשפו תחת שדה שעועית לימאה בעיירה צ'לסי. זה היה מאמץ שיתופי באמת; תושבי צ'לסי שונים הצטרפו לחפירה כששמעו את החדשות המרגשות. בשנת 2017 חוקרים מאוניברסיטת מישיגן גילו 40 עצמות ושברי עצמות נוספים באותו אתר, כולל חלקים מהגולגולת של החיה. מדענים אספו גם דגימות משקעים, בהן השתמשו כדי לתארך את המאובנים. הם מאמינים כי הוא בן יותר מ 15,000 שנה ונצוד על ידי בני אדם.
המאובן הרשמי של מישיגן, ה- מסטודון אמריקאי היה מחזה נפוץ במצב זה במהלך המלחמה פליסטוקן תקופה שנמשכה לפני כשני מיליון עד 10,000 שנה. מסטודונים - יונקים ענקיים קשורים מרוחקים לפילים - חלקו את שטחם עם צמריר ממותות, כמו גם מגוון רחב של יונקים אחרים של מגפאונה, כולל דובים בגודל פלוס, בונים ו צבי. למרבה הצער, אלה בעלי חיים נכחד זמן קצר לאחר עידן הקרח האחרון, ונכנע לשילוב של שינויי אקלים וציד על ידי הילידים הקדומים.
במשך 300 מיליון השנים האחרונות רוב מישיגן הייתה הרבה מעל פני הים - אך לא את כל זה, כפי שמעידים התגלית של מגוון לוויתנים פרהיסטורייםכולל דגימות מוקדמות של קטזינים שעדיין קיימים כמו פיזיטר (הידוע יותר בשם לוויתן הזרע) ו- Balaenoptera (לוויתן הסנפיר). לא בדיוק ברור כיצד לווייתנים אלו נפרדים במישיגן, אך רמז אחד עשוי להיות שהם ממוצא עדכני במיוחד, ישנם דגימות המתוארכות לפני פחות מאלף שנה.
מישיגן הייתה אולי גבוהה ויבשה במשך 300 מיליון השנים האחרונות, אך במשך למעלה מ -200 מיליון שנים לפני כן (החל מהאזור קמבריאנית תקופה) שטחה של מדינה זו היה מכוסה על ידי אוקיינוס רדוד, כמו גם בצפון אמריקה הצפונית. זו הסיבה שמשקעים המתוארכים ל אורדובי, סילוריאן, ו Devonian התקופות עשירות באורגניזמים ימיים קטנים, כולל מינים שונים של אצות, אלמוגים, ברכיפודים, טרילוביטים וקרינואידים (יצורים זעירים ועקומים הקשורים למרחק הכוכבים). אבן הפטוסקי המפורסמת של מישיגן - סוג של סלע עם דפוס מלוטש, ואבן המדינה של מישיגן - עשויה אלמוגים מאובנים מתקופה זו.