הם נלחמו בשיתוף פעולה עם האויב הפרסי במהלך המלחמות הפרסיות הממושכות, אך לאחר מכן היחסים, המתוחים אפילו אז, התפרקו זה מזה. יוונית נגד יוונית, מלחמת פלופונסיה לבשה את שני הצדדים כלפי מטה והובילה למדינה בה מנהיג מקדוניה ובניו, פיליפ ואלכסנדר, יכלו להשתלט.
מלחמת פלופונסיה נלחמה בין שתי קבוצות בעלות ברית של יוון. האחד היה הליגה הפלופונסיתאשר ספרטה הייתה המנהיגה שלה. המנהיג הנוסף היה אתונה, ששלטה ליגת הדליאן.
לפני מלחמת פלופונסיה (כל התאריכים במאה החמישית לפנה"ס)
| 477 | אריסטידס מהווה את ליגת הדליאן. |
| 451 | אתונה וספרטה חותמות על חוזה לחמש שנים. |
| 449 | פרס ואתונה חותמות על הסכם שלום. |
| 446 | אתונה וספרטה חותמות על הסכם שלום לשלושים שנה. |
| 432 | מרד פוטיאה. |
שלב ראשון במלחמת פלופונסיה (מלחמת הארכידמים) בין השנים 431-421
אתונה (תחת פריקולים ואז ניקיאס) הצליחו עד 424. אתונה מבצעת סיורים קטנים בפלופונס בדרך הים וספרטה הורסת אזורים באזורים הכפריים של אטיקה. אתונה מבצעת משלחת הרת אסון לבואוטיה. הם מנסים להחלים את אמפיפוליס (422), ללא הצלחה. אתונה חוששת שיותר מבני בריתה ידברו, ולכן היא חותמת על חוזה (שלום ניקיאס) המאפשר לה לשמור פניה, בעצם מחזירים את הדברים כפי שהיו לפני המלחמה פרט לעיירות פלטיאה ותראקיה.
| 431 | מלחמת פלופונסיה מתחילה. מצור פוטיאה. מגפה באתונה. |
| 429 | פריקלס נפטר. המצור על פלאטה (-427) |
| 428 | מרד מיטלין. |
| 427 | משלחת אתונה לסיציליה. [ראו מפה של סיציליה וסרדיניה.] |
| 421 | שלום ניקיאס. |
שלב שני במלחמת פלופונסיה בשנים 421-413
קורינתוס יוצר קואליציות נגד אתונה. אלקיביאדס מעורר צרות ומוגלה. בוגדת אתונה לספרטה. שני הצדדים מחפשים את ברית ארגוס אך לאחר קרב מנטינה, שם ארגוס מאבדת את מרבית הצבא שלה, ארגוס כבר לא משנה, למרות שהיא הופכת לבעלת ברית אתניה.
415-413 - משלחת אתונה לסירקוזה. סיציליה.
שלב שלישי של מלחמת פלופונסיה משנת 413-404 (מלחמת דקלון או מלחמת יונים)
בעצתם של אלקיביאדס, ספרטה פולשת לעתיקה, כובשת את העיירה דֶלְעֶה הסמוכה לאתונה [מקור: ג'ונה לנדרינג]. אתונה ממשיכה לשלוח אוניות וגברים לסיציליה למרות שזה אסון. אתונה, שהחלה את המלחמה ביתרון בקרב הימי, מאבדת את היתרון שלו לקורינתים ולסירקוסים. לאחר מכן ספרטה השתמשה בזהב הפרסי מכורש כדי לבנות את ציה, מעוררת צרות עם בעלות ברית אתניות ביוניה, והורס את הצי האתונאי בקרב על אגוסוטאמי. הספרטנים מובלים על ידי ליסנדר.
404 - אתונה נכנעת.
סיום המלחמה הפלופונסית
אתונה מאבדת את ממשלתה הדמוקרטית. השליטה מוכנסת לדירקטוריון של 30. בעלי ברית הנושא של ספרטה צריכים לשלם 1000 כישרונות בשנה. שלושים עריצים שלט באתונה.