תורת האבולוציה הייתה נושא לוויכוחים רבים בין הקהילות המדעיות והדתיות. נראה כי שני הצדדים אינם יכולים להסכים עם ההוכחות המדעיות והאמונות המבוססות על אמונה. מדוע נושא זה כה שנוי במחלוקת?
מרבית הדתות אינן טוענות כי המינים משתנים עם הזמן. לא ניתן להתעלם מהעדויות המדעיות המדהימות. עם זאת, המחלוקת נובעת מהרעיון שבני האדם התפתחו מקופים או פרימטים וממקורות החיים על כדור הארץ.
אפילו צ'ארלס דארווין ידע שרעיונותיו יהיו מעוררי מחלוקת בקהילות הדתיות כאשר אשתו התלבטה איתו לעתים קרובות. למעשה, הוא ניסה לא לדבר על אבולוציה, אלא להתמקד בהתאמות בסביבות שונות.
נקודת המחלוקת הגדולה ביותר בין מדע ודת היא מה שצריך ללמד בבתי ספר. המפורסם ביותר, מחלוקת זו הגיעה לראשונה בטנסי בשנת 1925 במהלך המלחמה משפט "קוף" של סקופס כאשר מורה מחליף נמצא אשם בהוראת אבולוציה. לאחרונה, מנסים גורמי מחוקקים במספר מדינות להחזיר את ההוראה לעיצוב אינטליגנטי ובריאה בכיתות מדע.
"מלחמה" זו בין מדע ודת הונצחה על ידי התקשורת. למעשה, המדע כלל אינו עוסק בדת ואינו מוכן להכפיש שום דת. המדע מבוסס על עדויות וידע על עולם הטבע. כל ההשערות במדע חייבות להיות מזויפות. דת, או אמונה, עוסקת בעולם העל טבעי והיא תחושה שלא ניתן לזייף. לפיכך, אין לייחס דת ומדע זה לזה מכיוון שהם בתחומים שונים לחלוטין.